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Alain Fischer est médecin, spécialiste en pédiatrie et en immunologie.
Après un stage postdoctoral à University College, Londres, il a initié une activité indépendante de recherche dans une unité Inserm située à l’hôpital universitaire Necker-Enfants Malades à Paris. Depuis 1991, il a été directeur de l’unité intitulée « développement normal et pathologique du système immunitaire ». Membre fondateur de l’Institut des maladies génétiques « Imagine » qu’il a dirigé de 2009 à 2016, localisé sur le même site.
Alain Fischer a été professeur de pédiatrie à l’université Paris-Descartes. De 1996 à 2012, il dirigea le service d’immunologie et hématologie pédiatriques à l’hôpital Necker-Enfants Malades.
Alain Fischer est aujourd’hui professeur au Collège de France, titulaire de la chaire de médecine expérimentale. Les travaux d’Alain Fischer concernent les maladies génétiques du système immunitaire et leur traitement notamment par thérapie génique. Alain Fischer est membre de l’Académie des sciences et de l’Académie de médecine.
Il a reçu le prix Jeantet, le grand prix de l’Inserm et le prix Japon.
Le 3 décembre 2020, Alain Fischer est nommé à la présidence d'un « Conseil d'orientation de la stratégie vaccinale » nouvellement créé et placé auprès du ministère des Solidarités et de la Santé13.